LKJ主机采用符合IEC国际标准的6U x 160标准机箱、插件结构。6U标准插件采用二个符合IEC标准的对外信号连接器，96芯连接器完成VME标准总线信号连接，48芯连接器完成输入/输出信号连接，在满足VME信号标准的同时，提高了板内的电磁兼容性。标准的模块化结构，可实现功能的扩充与升级。主机箱的选型及设计除在强度、重量、安装及电磁兼容等方面进行综合考虑外、还重点考虑了机箱的外观设计。装置在防止非法拔插电路板方面及记录数据人工防护方面也采取了有效的措施（在机箱正面加装带锁的玻璃门）。